Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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