Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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