Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHAF1AQ13111 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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