Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CNTN1Q12860 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CNTN1Q12860 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CNTN1Q12860 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CNTN1Q12860 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CNTN1Q12860 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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CNTN1Q12860 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTN1Q12860 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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