Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CD300CQ08708 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms