Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABPB1Q06547 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms