Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIP4K2AP48426 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIP4K2AP48426 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIP4K2AP48426 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIP4K2AP48426 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIP4K2AP48426 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIP4K2AP48426 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIP4K2AP48426 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms