Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA2P42262 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms