Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPC1P35052 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GPC1P35052 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GPC1P35052 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GPC1P35052 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GPC1P35052 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GPC1P35052 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GPC1P35052 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GPC1P35052 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GPC1P35052 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GPC1P35052 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GPC1P35052 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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GPC1P35052 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GPC1P35052 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GPC1P35052 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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GPC1P35052 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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GPC1P35052 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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GPC1P35052 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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GPC1P35052 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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GPC1P35052 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GPC1P35052 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GPC1P35052 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GPC1P35052 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPC1P35052 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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