Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL9P32969 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL9P32969 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL9P32969 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL9P32969 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL9P32969 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL9P32969 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL9P32969 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL9P32969 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL9P32969 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms