Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms