Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLD1P28340 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLD1P28340 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLD1P28340 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLD1P28340 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLD1P28340 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLD1P28340 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLD1P28340 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms