Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms