Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IL3RAP26951 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms