Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PTPRBP23467 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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PTPRBP23467 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PTPRBP23467 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PTPRBP23467 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PTPRBP23467 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PTPRBP23467 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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