Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms