Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT4P19013 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT4P19013 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRT4P19013 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms