Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 LINC01571-201ENST00000563603 811 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC010487.2-201ENST00000594546 486 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ACP1-203ENST00000405233 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 LINC00570-201ENST00000417473 1330 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB3P14651 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB3P14651 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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