Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTSLP07711 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSLP07711 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSLP07711 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSLP07711 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSLP07711 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSLP07711 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSLP07711 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSLP07711 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSLP07711 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSLP07711 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTSLP07711 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms