Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYBBP04839 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYBBP04839 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYBBP04839 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms