Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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UBXN7O94888 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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UBXN7O94888 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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