Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP9BO43861 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms