Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLDN25C9JDP6 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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