Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA6L9A6NEM1 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms