Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HPS5Q9UPZ3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms