Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGSF9BQ9UPX0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms