Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNRF3Q9ULT6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms