Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD3Q9UJU5 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms