Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFMBT1Q9UHJ3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms