Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
COPS7AQ9UBW8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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COPS7AQ9UBW8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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COPS7AQ9UBW8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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