Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRP2BPQ9P2M1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms