Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SH3BP4Q9P0V3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SH3BP4Q9P0V3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SH3BP4Q9P0V3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SH3BP4Q9P0V3 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SH3BP4Q9P0V3 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SH3BP4Q9P0V3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SH3BP4Q9P0V3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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