Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATG3Q9NT62 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATG3Q9NT62 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms