Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms