Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CIPCQ9C0C6 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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CIPCQ9C0C6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CIPCQ9C0C6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CIPCQ9C0C6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CIPCQ9C0C6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CIPCQ9C0C6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CIPCQ9C0C6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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