Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRP1Q9C000 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms