Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms