Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms