Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUFY3Q7L099 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms