Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMPD1Q5SYB0 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms