Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A12Q504Y0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A12Q504Y0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A12Q504Y0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A12Q504Y0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A12Q504Y0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A12Q504Y0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A12Q504Y0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A12Q504Y0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A12Q504Y0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A12Q504Y0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A12Q504Y0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A12Q504Y0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A12Q504Y0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A12Q504Y0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A12Q504Y0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A12Q504Y0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A12Q504Y0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A12Q504Y0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A12Q504Y0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms