Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GREB1Q4ZG55 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.6 ms