Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC010997.4-201ENST00000609200 1890 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GPR156-202ENST00000461057 2525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA31C1-202ENST00000602681 1927 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms