Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGSM1Q2NKQ1 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms