Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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