Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 GPR37L1-201ENST00000367282 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 KCNV1-202ENST00000524391 6979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SMAD9-201ENST00000350148 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
VAMP3Q15836 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms