Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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TAF1AQ15573 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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