Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF4Q15306 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF4Q15306 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms