Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms