Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RAB39AQ14964 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms